Francesco Bagnaia alcanzó una victoria impresionante en la Sprint del Gran Premio de Malasia, controlando la carrera desde la pole position. Detrás de él, Alex Márquez selló su subcampeonato de manera matemática, y en el tercer lugar, Fermín Aldeguer finalizó en el podio, llevándose el galardón de 'Rookie del Año'.
Una vez que los semáforos se apagaron, Bagnaia demostró su superioridad con un inicio espectacular que le otorgó el control de la carrera. Detrás de él, Alex Márquez y Pedro Acosta lo seguían de cerca; sin embargo, pronto el "Tiburón de Mazarrón" superó a Márquez, posicionándose en segundo lugar. Mientras tanto, Joan Mir luchaba por mantener la competitividad en los primeros giros, y Franco Morbidelli, quien había comenzado en tercera posición, comenzó a perder terreno rápidamente.
A medida que la carrera avanzaba, más de un segundo y medio de ventaja sobre sus competidores acumulaba Bagnaia. En la zona de puntos, junto a Fabio Quartararo y Johann Zarco, se mantenía firme Aldeguer, mientras que tras los problemas iniciales, Pol Espargaró y Luca Marini peleaban por posiciones importantes.
Con apenas tres vueltas por completar, las posiciones en la carrera parecían estar claras: Bagnaia dominaba la competencia con comodidad, mientras que Márquez se aseguraba el subcampeonato. No obstante, Acosta se encontraba bajo la presión de Aldeguer, quien estaba decidido a arrebatarle el tercer lugar. En este emocionante enfrentamiento entre los murcianos, Aldeguer logró salir triunfante, consolidando así su título como 'Rookie del Año' y resaltando el notable desempeño del equipo Gresini en esta carrera y temporada 2025.
Por otro lado, la jornada resultó menos positiva para Honda HRC Castrol; tras el accidente de Mir, Luca Marini también tuvo un percance debido a un insólito incidente con Pol Espargaró.
Una vez que se definió el podio, Acosta y Morbidelli completaron el Top 5. Por su parte, Bezzecchi realizó una espectacular remontada que lo llevó hasta la séptima posición. Los últimos puntos fueron obtenidos por Zarco y Enea Bastianini, mientras que Fabio Di Giannantonio quedó fuera de la puntuación.